Jocurile Olimpice din 1906 de la Atena s-au dovedit a fi extraordinare, deoarece organizatorii săi nu au respectat cerința unei pauze tradiționale de patru ani între jocuri. Din acest motiv, Olimpiada nu a fost nici măcar recunoscută oficial de Comitetul Olimpic Internațional.
Jocurile din 1906 au avut loc în onoarea a zecea aniversare a primelor Jocuri Olimpice, care a avut loc și la Atena. Pentru a sublinia în continuare legătura dintre cele două evenimente, organizatorii Olimpiadei au ales aceeași schemă de competiție ca în 1896. În mare parte, competițiile au avut loc pe Marble Stadium.
La început, când o propunere a venit din Grecia de a găzdui Olimpiada din 1906, COI nu a dat un refuz categoric. Cert este că până atunci prestigiul Jocurilor Olimpice scăzuse, iar publicul nu-și mai arăta interesul pentru ei. Pentru a preveni prăbușirea definitivă a mișcării olimpice, a fost necesară luarea de măsuri și nu mai era posibil să aștepți până în 1908. Și deși ulterior refuzul de a recunoaște Jocurile Olimpice din 1906, IOC va fi numit salvarea jocurilor, ceea ce a permis întoarcerea interesului publicului și mai ales a sportivilor pentru eveniment, pentru a susține mișcarea și chiar ideea ei.
Dificultatea a fost și faptul că, potrivit tradiției, Olimpiada trebuia să aibă loc în diferite țări ale lumii, dar în 1906, evenimentul era planificat să fie organizat în Grecia, ceea ce a provocat nemulțumirea membrilor COI. Într-un fel sau altul, însă pe 22 aprilie a avut loc marea deschidere a jocurilor. Întrucât mass-media a acordat multă atenție Olimpiadei din 1906, mulți sportivi și invitați au ajuns la Atena.
La eveniment au participat aproximativ 900 de sportivi din 20 de țări, printre care șapte femei. În cadrul Olimpiadei din 1906, s-au desfășurat competiții în următoarele sporturi: haltere, lupte greco-romane, scrimă, canotaj, navigație, înot, scufundări, atletism, tir de bancă și glonț, ciclism și tenis. Din păcate, din moment ce IOC nu a recunoscut Jocurile Olimpice din 1906, toate premiile primite de participanții săi au fost invalide și nu au fost luate în considerare în viitor.
Ceremonia de închidere a Olimpiadei a avut loc pe 2 mai. După eveniment, rezultatele sale au fost discutate mult timp în diferite țări, ceea ce a crescut semnificativ interesul public pentru jocuri. Acest lucru s-a remarcat mai ales în timpul Jocurilor Olimpice de la Londra din 1908, la care au participat peste 2.000 de sportivi.